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16S/18S/ITS測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)分析
【添加時(shí)間:2016-07-21 16:47:49】【來(lái)源:】【作者:dggadmin】
原核16S rRNA基因、真核18S rRNA基因、真菌ITS擴(kuò)增子測(cè)序結(jié)果使用Qiime、RDP、Usearch等標(biāo)準(zhǔn)分析流程進(jìn)行質(zhì)量控制和分析(見(jiàn)下圖)。
圖1. 16S/18S/ITS擴(kuò)增子測(cè)序分析流程
說(shuō)明:
1)16S rRNA PCR過(guò)程可能會(huì)擴(kuò)增出真核生物葉綠體或線粒體基因,如果您的樣品含有大量未降解的動(dòng)植物/藻類細(xì)胞,需注意這個(gè)問(wèn)題,以免測(cè)序結(jié)果不可用;
2)個(gè)性化分析和環(huán)境因子分析不包含在標(biāo)準(zhǔn)分析流程內(nèi),屬于定制的增值服務(wù)。
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