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非參數(shù)多元方差分析 (PerMANOVA)
【添加時間：2016-09-12 09:39:42】【來源：】【作者：dggadmin】
PerMANOVA分析(也叫NPMANOVA、Adonis分析)是一種以距離矩陣為對象的多元方差分析。
以圖1的PCoA圖為例，橢圓圈出的四組樣品點正好對應(yīng)四個海拔分組，這四組樣品之間的群落差異是否顯著呢？檢驗組間群落差異本質(zhì)上是檢驗距離矩陣之間的差異，普通的ANOVA分析無能為力。而基于距離矩陣的PerMANOVA分析則表明，這四個分組兩兩之間差異是顯著的(p<0.05)。
圖表出處：Rui J, Li J, Wang S, An J, Liu W-t, Lin Q, Yang Y, He Z, Li X 2015. Responses of bacterial communities to simulated climate changes in alpine meadow soil of Qinghai-Tibet plateau. Applied and Environmental Microbiology 81: 6070–6077
以圖1的PCoA圖為例，橢圓圈出的四組樣品點正好對應(yīng)四個海拔分組，這四組樣品之間的群落差異是否顯著呢？檢驗組間群落差異本質(zhì)上是檢驗距離矩陣之間的差異，普通的ANOVA分析無能為力。而基于距離矩陣的PerMANOVA分析則表明，這四個分組兩兩之間差異是顯著的(p<0.05)。
圖1 PCoA分析
表1.樣品分組之間的群落差異p值 (PerMANOVA)
圖表出處：Rui J, Li J, Wang S, An J, Liu W-t, Lin Q, Yang Y, He Z, Li X 2015. Responses of bacterial communities to simulated climate changes in alpine meadow soil of Qinghai-Tibet plateau. Applied and Environmental Microbiology 81: 6070–6077
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